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有没有人反向PCR以后,连到载体上,测序发现:只有引物正确,其它的都不是目的序列

来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/04/30 03:15:53
有没有人反向PCR以后,连到载体上,测序发现:只有引物正确,其它的都不是目的序列
就是说反向PCR后,扩增出来的序列本应该是有酶切位点的,结果测序结果显示没有那个酶切位点,但是却有引物序列.
是不是你的引物扩出了非特异的条带啊,可能是你引物设计问题,不排除你模板问题.如果只是回收过程中紫外造成的突变,不应该是整个基因都不对,如果其他序列比对没有问题,只是酶切位点的问题,你要考虑是不是突变了.
再问: 其他序列也有问题,也找不到酶切位点,只能找到引物!也就是说和我已知的部分序列没有相似,本来应该有的没切位点却没有了!!谢谢,呵呵这是怎么回事啊??这个实验是这样的,我们先把一个已知部分序列的片段用Hind3酶切,然后让让其自连成环,然后依据已知片段设计引物进行反向PCR,与载体连接后,上海生工测序(测通),结果找不到Hind3酶切位点。
再答: 你好,我有问题不懂。第一,你既然知道其他序列有问题,那么你必然知道其他序列,那么为什么还要用反向pcr的方法,直接设计引物pcr不就对了。第二,如果你不知道序列,那么你怎么知道本身是否包括hind3的位点。第三,你原来的hind3位点不该在两个引物之外吗?