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基因克隆实验克隆实验问题 1、以cDNA为模板做PCR反应,得到的产物和预期的长度一样.2、再用pMD-19载体连接目的

来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/04/30 20:15:00
基因克隆实验
克隆实验问题
1、以cDNA为模板做PCR反应,得到的产物和预期的长度一样.
2、再用pMD-19载体连接目的片段,之后液体LB(含氨苄)200转震荡培养1-2小时,取300微升倒在LB平板培养24小时左右,以菌落长到直径1-2毫米为止;再挑3-5个单克隆放大培养24小时左右.
3、裂解菌体后,4°C ,12 000 g ,离心20-30分钟,取上清液.
4、PCR检测所得裂解后上清液(引物为M13-47,RV-M),得到了目的片段大小的产物(稍长些).
5、送菌液上清液测序(使用通用引物M13-47),但是测序结果却是如下其概况:在载体插入点之间的序列BLAST后,显示为杆菌等细菌的片段,共送了16个样品均是如此(本实验应该是动物的序列),看来不是空载,难道是载体连接上了细菌的一段序列,为什么会插入细菌片段呢,而且长度就这么巧!还是其他什么原因呢,恳请赐教!
目的基因是动物的相关基因片段PCR扩增的吗?你采用mRNA还是DNA啊?是扩增16SrDNA?不然怎么会显示杆菌的片段?BLAST比对如此奇怪?应该不会插入错误16组,估计实验操作的问题,或者使用NCBI比对生物信息时有误.说的够概况的,不太清楚,也很好奇,能不能步骤表述详细点?
一个好办法,克隆的菌落可以甘油保藏后直接送去测序,但是要告诉测序公司是甘油管样品.这样就可以看看是不是你前面的步骤有误或污染了.