primer 5设计引物都有find 出现
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/19 07:37:12
这里有primerblast,使用相当方便,就是网速有点慢
不能需要注册器
引物的设计一般要考虑以下几个问题:1.长度,至少要16bp,通常为18-30bp2.解链温度(Tm值)3.避免引物内部或引物之间存在互补序列(3个碱基),从而减少引物二聚体的形成以及引物内部二级结构的
用PP5.0或oligo软件.网上有很多说明书的,操作十分简单再问:等于白说
这个百度看一下吧
首先引物要跟模板紧密结合,其次引物与引物之间不能有稳定的二聚体或发夹结构存在,再次引物不能在别的非目的位点引起DNA聚合反应(即错配).围绕这几条基本原则,设计引物需要考虑诸多因素,如引物长度(pr
选取目标片段长度在80-250bp的引物,在回头BLAST,特异性良好的话就可以了,一般我会多设计几个,选取最好的那个~
请问你试过几对引物?用过多少种酶跟退火温度还有延伸温度,pcr扩增的体系是要你慢慢摸索的试试用Extaq高保真的酶扩增如果在基因组上扩增建议你退火温度从55°开始扩,逐渐降低温度再问:引物大概有4对了
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
用primerpremie
Tm值本来就是人为定的一个预测值,三个Tm值代表的是不同的计算方法,常用的是第三种2*AT+4GC.看退火温度时,酶切位点和保护碱基一般是不考虑在内的,因为pcr扩增时这段序列一般是不跟模板结合的,所
一般引物设计时,要保证有12-15个碱基和模板完全匹配.而且引物的3‘端不能与其他位置配对,不能被封闭,最多封闭3个碱基.上游引物,下游引物,和他们之间尽量减少二聚体.保证GC含量在45-55之间.还
是从NCBI里面的序列库中搜索的,自动搜索符合筛选条件的序列,从而给出引物序列blast是要求NCBI里面有的序列才能验证.你研究的物种基因组测序结果发布了吗?如果发布了的话就不用担心序列不全了
用DNASTAR还不错!或者直接用FRIMER再问:探针设计呢再答:基因探针设计其实和引物设计没什么很大的差别,就是你设计的引物在合成的时候需要进行碱基修饰
NoePrimer:独一无二的引物设计工作站NoePrimer是独特的引物设计软件,它可以把繁杂的引物设计过程简单化,满足您复杂而专业的设计需要.NoePrimer为引物设计提供了简单的、直观的、图形
首先查道你的基因序列(NCBI搜),第二查引物设计原则,第三下载个引物设计软件设计,简单好用的有primerpremier5.0,这些都能在网上搜到,软件用法也能搜到.
我也做得RT-PCR,是提取某物种中未测序的一段基因.是用近缘物种基因进行比对,得到保守序列设计引物,再提取总RNA,RT-PCR得到目的基因的片段再问:我需要检测的分子,在nucleotide里找不
可以在引物上添加不配对的碱基,但是在引物的3‘端,至少有三个碱基是严格配对的.但是这样的操作主要是为了添加酶切位点或者flag等.Tm值是根据两条链的退火情况来计算,不配对的碱基不算在内,所以你添加不
不用太纠结,有点儿具体也是可以的,一般都能P出来.再问:很多mRNA选择设计不同长度的引物,没有一对是无found显示的,真的很让人纠结;请问文献上的引物有的也是这样吗,不完美,但能扩出来,不会影响q