已知基因序列,mrna序列,怎样用blast分析内含子和外显子
来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:语文作业 时间:2024/04/29 09:04:22
已知基因序列,mrna序列,怎样用blast分析内含子和外显子
使用blastn里面的 “Align two or more sequences”,出现两个输入序列的窗口,分别输入基因组序列和mRNA序列,mRNA序列最好只选取CDS输入进去.
出现比对结果后,CDS序列会和基因组相应的部分区域完好的匹配,出现几段区域就应该有几个外显子.
但是这样的比对不能很好的区分内含子和外显子的边界,内含子和外显子的边界序列最好根据GT.AG规则去手动分辨,一般内含子的边界序列都有典型的特征:5'GT.AG3',同时还要兼顾mRNA各外显子的连续性,不要出现重叠区域.
出现比对结果后,CDS序列会和基因组相应的部分区域完好的匹配,出现几段区域就应该有几个外显子.
但是这样的比对不能很好的区分内含子和外显子的边界,内含子和外显子的边界序列最好根据GT.AG规则去手动分辨,一般内含子的边界序列都有典型的特征:5'GT.AG3',同时还要兼顾mRNA各外显子的连续性,不要出现重叠区域.
已知基因序列,mrna序列,怎样用blast分析内含子和外显子
线虫的mRNA去哪里下载?还有它的基因间序列,CDS序列,外显子,内含子序列.
知道了基因的mRNA,怎样通过mRNA找到它的内含子序列
mrna序列中包含内含子序列信息吗?
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某一基因序列 由于只能查到人的和鼠的 请问 怎么通过已知的人和鼠的基因序列 blast出相应猪的基因序列
真核细胞的结构基因中,具有编码功能并在成熟mRNA上反映出来的序列称为 .A.启动子 B.外显子 C.内含子
和cDNA相比,DNA序列中多出的基因间序列被称为() A、操纵子DNA B、调控子DNA C、外显子DNA D、内含子