作业帮如何查找乳腺癌突变基因TNRC9的基因序列?如何设计引物?
来源：学生作业帮 编辑：拍题作业网作业帮 分类：综合作业 时间：2024/04/28 13:59:25
如何查找乳腺癌突变基因TNRC9的基因序列?如何设计引物?
NCBI里列出好多带编号的条目，哪个才是呢？
NCBI里列出好多带编号的条目，哪个才是呢？
建议你从NCBI的gene数据库入手.
首先,因为TNRC9是TOX3基因以前的别称,所以用"TOX3"很容易就可以找到人类的TOX3基因（GeneID:27324）.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=27324&ordinalpos=2&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Gene.Gene_ResultsPanel.Gene_RVDocSum
然后,您可以在此记录中找到NM_001080430.2登录号,点击进入就是您要找的基因序列.
这个基因一共有七个外显子,最常的有1000多个bp,测序的难度大一些.
通常设计引物是针对外显子进行的,需要取得外显子及其上下游一小段序列.cxbmh朋友的建议不错,你可以自己试试.
设计的引物一般会有许多对.设计好后,你可以把引物和序列丢给 primer blast看看引物在基因组上是否有多个靶点,以增加引物设计的成功率.
引物
首先,因为TNRC9是TOX3基因以前的别称,所以用"TOX3"很容易就可以找到人类的TOX3基因（GeneID:27324）.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=27324&ordinalpos=2&itool=EntrezSystem2.PEntrez.Gene.Gene_ResultsPanel.Gene_RVDocSum
然后,您可以在此记录中找到NM_001080430.2登录号,点击进入就是您要找的基因序列.
这个基因一共有七个外显子,最常的有1000多个bp,测序的难度大一些.
通常设计引物是针对外显子进行的,需要取得外显子及其上下游一小段序列.cxbmh朋友的建议不错,你可以自己试试.
设计的引物一般会有许多对.设计好后,你可以把引物和序列丢给 primer blast看看引物在基因组上是否有多个靶点,以增加引物设计的成功率.
引物
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