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已知氨基酸序列,要查找同源最高的水稻基因,用blast该怎么做?大致方法怎样的?

来源：学生作业帮 编辑：拍题作业网作业帮 分类：综合作业 时间：2024/04/28 19:08:44
已知氨基酸序列,要查找同源最高的水稻基因,用blast该怎么做?大致方法怎样的?
分析下列序列,并找出与之同源性最高的水稻基因,并尝试利用RGP网站对其功能进行预测分析.
MGASVSRGRAARVPAPEPEPEEALDLSQLPPELLLVVLSHVPPRTLLGRCRQVCRGWRALVDGQALWLLILARDHGATGRALLHLARSCQSPARNARPCPLGRFCARRPIGRNLIRNPCGQEGLRKWMVQHGGDGWVVEENRTTVPGAPSQTCFVTSFSWCCKKQVLDLEEEGLWPELLDSGRIEICVSDWWGARHDSGCMYRLLVQLLDANQTVLDKFSAVPDPIPQWNNNACLHVTHVFSNIKMGVRFVSFEHRGQDTQFWAGHYGARVTNSSVIVRVRLS
使用NCBI在线查询http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE_TYPE=BlastHome
hypothetical protein OsI_12573 [Oryza sativa Indica Group]
已知氨基酸序列,要查找同源最高的水稻基因,用blast该怎么做?大致方法怎样的? 已知一个小鼠的基因完整序列和CDS序列,请问如何查找这个序列在水稻中的同源基因序列 在NCBI上怎么查找某一基因在不同种属中已公布的同源序列 检测到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不同源的,请问 用BLAST查找protein 输入的是基因的名字,查出来的是对应的蛋白序列吗? 已知一蛋白质的部分氨基酸序列,怎样克隆编码该蛋白的基因? 某一基因序列 由于只能查到人的和鼠的 请问 怎么通过已知的人和鼠的基因序列 blast出相应猪的基因序列 已知蛋白质的氨基酸序列,如何求出编码该蛋白的基因序列 已用本地blast找出基因序列,怎么确定它是全长的呢? 如何寻找一段基因的同源序列?如何利用网络查找一段基因的上游调控序列? 用转录组测序的数据库查找两个不同的基因,结果blast后显示的是相同的序列,这是为什么,怎 80.6% 的拟南芥基因与该水稻的基因同源,但该水稻只有49.4%的基因与拟南芥的基因同源.