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你克隆过未知的基因吧?我也要克隆一个未知基因.我有以下疑问:1,我克隆鱼的一个未知基因.我该找多少生物的该基因来比对找保

来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/05/21 22:50:33
你克隆过未知的基因吧?我也要克隆一个未知基因.我有以下疑问:1,我克隆鱼的一个未知基因.我该找多少生物的该基因来比对找保守区.因为鱼类的比较少,就两种鱼NCBI里面有Sequence,还是预测的,我不得不找人类,小鼠等哺乳动物的该基因来补上.同源性还是有80%的.2,简并引物设计5对够不够?3.从开始到拿到基因全长抓紧时间的话要多久?
对比基因,建议你还是从蛋白入手.毕竟基因本身保守不保守或者序列如何并没有意义.基因存在的真正意义绝大多数还是靠表达蛋白来完成对性状的控制.有了基因序列就能得到氨基酸序列,然后通过氨基酸比较就会很有说服力,而且结果更明显.
关于鱼类的基因设计较少,我做的多数还是癌细胞和微生物的,也有一部分病毒.建议你看看不同生物的密码子偏好,多利用鱼和水生生物的的序列来设计简并引物.至少在我做过的来说,人源基因3-4对就基本没什么问题,至于鱼的,同源性上肯定是个问题,至于5对够不够我也说不太好.
关键最后的比较看你要做到什么程度,如果就是提全DNA,PCR,然后分离测序的话,应该很快的,顺利的话1-2两周应该没有问题,但要看测序公司的效率.