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已知基因名和cDNA位点,如何找到相对应的DNA序列上的位点?

来源：学生作业帮 编辑：拍题作业网作业帮 分类：生物作业 时间：2024/05/01 00:53:02
已知基因名和cDNA位点,如何找到相对应的DNA序列上的位点?
例：已知基因名PLEC,NM_201384,exon1,c.14A>G.现在要验证c.14A>G这个位点是否发生突变.我在NCBI中可以查到这个基因相对应的mRNA的序列,可以以mRNA序列设计引物么?这对因为可以对gDNA进行扩增么?c.14这个位点对应到gDNA序列中是哪个位点?
你找的14a在这里,通过上下游的碱基搜索就可以了.
可以根据mRNA序列设计引物,扩增gDNA,但必须注意,引物必须在同一个exon上.如果扩增的片段跨了一个或几个intron,还要用到long PCR的酶.
有个比较简单的方法,反转录mRNA,以cDNA为模板,就没有上述的限制了.
再问： 多谢！
不过这个点是如何确定的？怎样才能保证引物在同一个exon上呢？
再答： 引物设计软件，例如PP6，可以设定引物的位置
已知基因名和cDNA位点,如何找到相对应的DNA序列上的位点? 假如你克隆到一条全长cDNA序列和该基因位点的gDNA序列,试用已学的生物信息学知识,围绕这两条系列 什么是基因位点?xa5基因于染色体第39位点上,这个39位点是这条染色体上的位点,还是水稻全序列的位点,这个位点的定位是 在操纵子上,DNA可与蛋白质或酶结合的区域包括A启动序列B结构基因C CAP结合位点 D调节基因E操纵序列 如何标记出一段DNA或RNA序列上对紫外线高敏感位点 如何通过直接测序法查找SNP位点,已扩增得到多个个体的DNA序列 和cDNA相比,DNA序列中多出的基因间序列被称为（） A、操纵子DNA B、调控子DNA C、外显子DNA D、内含子 我现在有了一个基因的cDNA序列,现在想找到这个基因的内含子序列,怎么办? 如何找一个基因的转录起始位点 如何获得基因的全长(包括基因的DNA结构和cDNA结构) 求教DNA上的相应位点是什么意思 已知一个cDNA的3'端部分序列,得到该基因的全长cDNA