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编写一段关于blast提取序列的Perl语言

来源：学生作业帮 编辑：拍题作业网作业帮 分类：综合作业 时间：2024/04/28 13:26:22
编写一段关于blast提取序列的Perl语言
目的：根据信息,提取名称
举例：
.
大概就是这样的,“*”是其他信息,主要就是在“20140101 seqs1”和“20140102 seqs1”这里,blast结果是seqs1的20140101和20140102都提取出来,而blast结果是seqs2的不提取.
$  grep -n “seqs1”  |less如果想输出到某个文件 |less 改为 >youwant.txt
再问： ��д��ϸ�����ҵ�perl��Ϊ0.0000000001. �鷳�ˣ�����
再答： ����˵�ɣ� grep ��liunx�²��ҵ�һ�����grep 'seqs1'����˵�ҵ�����seqs1����,Ȼ��test.txt������㽨�ģ�����������ļ����������ij�����ļ�·���Ϳ��� �����ǵ�Ŀ��������������ֻ���뿴��| less �ǽ�֮ǰ�õ��Ľ���ҵ�����seqs1���У���ʾ�������Ļ������һ�� >youwant.txt��˵ָ��һ����Ϊyouwant.txt���ļ���Ϊ������������ij�����Ҫ�����·������,-n��ʾѡ���������Ƕ��٣�����Ҫ����ȥ����ֱ�������liunx���������� grep 'seqs1' test.txt |less ����˵���뵥��Ҫһ��peri�Ĵ��룿
再问： ��������Ҫһ��perl�Ĵ��룬�ҵ�liunx=0.���ԡ�����������
再答： #!usr/bin/perluse warnings;use strict;use Getopt::Long;my $testFile;GetOptions("testFile:s" => \$testFile,     );print "not exist testFile\n" if ( ! -e $testFile);open (IN,"<$testFile") or die ;while (my $line=<IN>) {     if ($line=~/(^.+seqs1)/){         my $seqs1=$1;         print "$seqs1\n";     } }����Ӧ�ú�����ˣ���windowϵͳ�� ��windowȻ������cmd��֮��ͼperl �������Ŀ�ִ���ļ������������д�Ĵ��룬·�ߺ����ָij����Լ��ģ�-testFile ������ļ���·�����ij����Լ��Ϳ��ԡ�

编写一段关于blast提取序列的Perl语言 用perl语言测DNA序列,全部分给你! 求一段perl分割fasta中DNA序列的代码 fasta文件中有数千条DNA序列,都是按照注释, perl语言中遇到的情况 用BLAST对比了两个蛋白序列的相似性 C语言随机数序列编程：用C语言程序编写.生成随机数序列.范围：1-15要求生成1-15的随机序列,中间无重复 检测到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不同源的,请问 请帮忙解释一下下面的perl语言的意义 关于一段NCBI上没有的基因序列 有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成! ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?