微生物基因序列对比差异大于多少可判定为不同种属?

来源：学生作业帮编辑：拍题作业网作业帮分类：生物作业时间：2024/05/07 05:17:11

微生物基因序列对比差异大于多少可判定为不同种属?
相似度小于百分之几的断定为不同种?
相似度小于百分之几的断定为不同属?
2006-6-18补充说明：
就是16S rDNA在NCBI的BLAST结果
当然这不能作为判断种属的确定依据
但是有说法称一般Identity小于99%即可初步认为是不同种
但是小于百分之多少初步认为是不同属？
可能是我先前表述不够清楚

1.DNA G+Cmol％ GC含量差异即可确定DNA的不同,这是真菌分类鉴定的重要遗传指标之一.一般认为,G+C mol%差别大于20%是不同属的菌；差别在10%～15%之间是同属不同种,差别在5%以内则可能是种内不同菌株.但是G+Cmol％相同也不能判断属于同一个种,因此,G+Cmol％只具有否定价值
所以最重要的方法是核酸杂交技术,其中应用最多的是DNA-DNA杂交,即:
2.采用示踪物标记的一条DNA分子与另一条在适当条件下杂交,可获得两者间的杂交百分率即DNA同源性,以此判断两菌株是否属同一种.一般在相同的菌种中,DNA/DNA杂交的成功率高达80%以上,若低于20%基本可考虑为无关菌系,65%～80%之间的菌有较多的同源性,提示为同一属的不同种.但如结果在20%～25%范围时则难以作出判断,应并用其它方法分析确定
3.对属或属以上水平的分类则采用DNA/rRNA杂交,因为rRNA在进化过程中保守性更强.例如,Kurtzman等在对黄曲霉群中各菌种的DNA关系研究中,黄曲霉和寄生曲霉显示79%的DNA杂交率,而集峰曲霉和黄曲霉的DNA杂交率只有39%.Kurtzman根据这些研究结果建议把黄曲霉和寄生曲霉划为黄曲霉的两个变种,而集峰曲霉则划分为一个新种.
但由于该技术操作复杂、费时,并且在细菌分类上其应用价值没有测定rRNA序列有意义,所以该技术没有被广泛应用.

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