请问DNA 在 SHOTGUN SEQUENCING 后如何组合成原来的DNA
来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:语文作业 时间:2024/04/28 20:57:30
请问DNA 在 SHOTGUN SEQUENCING 后如何组合成原来的DNA
就是在用那个 string graph 来组合回原来的DNA 序列的时候,如果遇到其中某一段(即GRAPH中的一个节点)是取的不同方向(即是DNA中的另外一个DNA链)的话,应该如何修改string graph呢
我的意思是,完全不知道这些段里面,哪些是来自一条链的,哪些是来自另一条链的,所以有的段是正向(foward),有的段是反向相反(reverse complement).
在这种情况下,应该怎么修改原来的拼接图,可以得到原来的DNA。
就是在用那个 string graph 来组合回原来的DNA 序列的时候,如果遇到其中某一段(即GRAPH中的一个节点)是取的不同方向(即是DNA中的另外一个DNA链)的话,应该如何修改string graph呢
我的意思是,完全不知道这些段里面,哪些是来自一条链的,哪些是来自另一条链的,所以有的段是正向(foward),有的段是反向相反(reverse complement).
在这种情况下,应该怎么修改原来的拼接图,可以得到原来的DNA。
你是指在拼接的时候如果只知道双链里另一条链的情况吗?
英语翻译Problem 11:DNA Sequencing [Jacob Steinhardt,2010]Farmer
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