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我要测染色体上某一个基因,如何获得 这个基因,及如何判定这个基因就是你想要得到的

来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/04/28 13:19:15
我要测染色体上某一个基因,如何获得 这个基因,及如何判定这个基因就是你想要得到的
你知道这段基因两端的序列吗?
可以从NCBI上查(前提是有人测过),查出来之后根据两端的序列设计特异性引物,提出基因组DNA,PCR (要用最保守的enzyme,不要有错配).之后跑电泳,看长度对不对,对的话应该就是你要的,不对的话把长度对的PCR产物从胶上切下来回收.
再问: 要是测这个基因是否发生突变用哪个方法
再答: 找两端的保守区设计引物,就是基本上不会发生突变的区域,这个要多查文献,基本上文献中会说哪些点容易突变。 如果片段短的话可以连在质粒上测。主要有以下步骤: 1.建议设计引物时在引物两端加入酶切位点,然后PCR(注意用保守的DNA聚合酶,不然会有错配),跑电泳检测产物的长度,如果对的话切胶回收。 2.酶切PCR产物及质粒,再跑电泳,回收长度正确的片段,连接到酶切后的质粒上。 3. 用抗生素和蓝白斑筛选看PCR产物是不是插进质粒了。 4a.用插入片段两端的质粒序列设计引物(注意要在插入序列两端留出100bp左右的长度,原因是测序仪测不出前几十个碱基,给引物取个名字,如pf,pr),PCR,电泳看看插入的长度对不对(这个时候可以不用保守的DNA聚合酶,最便宜的taq酶就可以)。 4b.或者扩增单菌落,提质粒,酶切质粒,通过酶切片段大小看插入的长度是不是对。如果长度对的话就可以正式进行测序了。 5. 测序的过程很简单,用你根据质粒序列设计的引物pf 或者pr进行测序,【不可以两个加到一个tube里,那成PCR了:)】。如果插入的序列很短,低于500bp(最长800bp,如果你有很好的加样技巧的话),只需要进行一个方向测序就行,大于这个长度要用pf和pr分别测序。测出来之后和没有突变的序列比对一下就知道是不是突变了。 看上去挺复杂的吧,一般硕士研究生阶段的分子生物学实验半个学期都在做类似的实验。如果你从没有做过这样的实验可能会比较麻烦的,有熟手带着你就容易多了。