作业帮如何在人类基因组中查找只有10bp的序列
来源：学生作业帮 编辑：拍题作业网作业帮 分类：综合作业 时间：2024/04/28 08:07:41
如何在人类基因组中查找只有10bp的序列
核苷酸序列为10bp,要知道其在基因组中的位置,最后能再知道其周围的基因情况
前几天我已经用NCBI上的BLAST找过，每次都是No significant similarity found,可能是一些参数没设对，但是我已经试过好多次了，都没有结果，希望熟悉BLAST的朋友帮忙看看，我想找的其中一个序列是：GGGACTTTCC,能找到的话望不吝赐教，E-mail：succeedinnanjing-bd@yahoo.com.cn
另外，这几天我用另一个网站找到了该序列的一些信息，Chromosomal Coordinates[start..end]:NC_000001.9[407658..407667]......NC_000006.10[4421472..4421481] NC_000007.12[81516883..81516892]......NC_000016.8[13100669..13100678]......,请问这是不是其在染色体上的位置，可否利用这个查找其周围（比如1kb内的，或10KB,1000KB,甚至更长）基因的情况。可以的话，具体该如何做，不过不要把NCBI上HELP里的说明文件给我，我已经从NCBI上下了，我想得到具体的操作步骤。
还有就是我也给NCBI上发过邮件询问，blast-help@ ncbi.nlm.nih.gov和blast@ ncbi.nlm.nih.gov都发过，怎么没回答呢？
有人能帮我的话，我可以再追加分数。
核苷酸序列为10bp,要知道其在基因组中的位置,最后能再知道其周围的基因情况
前几天我已经用NCBI上的BLAST找过，每次都是No significant similarity found,可能是一些参数没设对，但是我已经试过好多次了，都没有结果，希望熟悉BLAST的朋友帮忙看看，我想找的其中一个序列是：GGGACTTTCC,能找到的话望不吝赐教，E-mail：succeedinnanjing-bd@yahoo.com.cn
另外，这几天我用另一个网站找到了该序列的一些信息，Chromosomal Coordinates[start..end]:NC_000001.9[407658..407667]......NC_000006.10[4421472..4421481] NC_000007.12[81516883..81516892]......NC_000016.8[13100669..13100678]......,请问这是不是其在染色体上的位置，可否利用这个查找其周围（比如1kb内的，或10KB,1000KB,甚至更长）基因的情况。可以的话，具体该如何做，不过不要把NCBI上HELP里的说明文件给我，我已经从NCBI上下了，我想得到具体的操作步骤。
还有就是我也给NCBI上发过邮件询问，blast-help@ ncbi.nlm.nih.gov和blast@ ncbi.nlm.nih.gov都发过，怎么没回答呢？
有人能帮我的话，我可以再追加分数。
10bp的基因很难找到,因为碱基不过ATCG四种10个bp的组合就等于4的十次方,这个数在基因组中微乎其微,重复的序列可能很多,尤其是赶上高拷贝段的时候,不过如果你这10bp十分特异还是有希望的.把你的序列拿到NCBI上blast看看有没有结果,如果有的话NCBI上就能提供其在基因组中的位置,以及其周围的基因情况
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