作业帮有一段mRNA序列怎么设计引物
来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/04/28 20:24:45
是否有引物序列要看你是如何测序的,如果短片段700个碱基以内双向测序且测序结果很好的情况下,应该能看到两端引物序列,如果是单向测序会看到一端引物序列；长片段一般是看不到引物序列的.你说的切除引物序列是
从NCBI中下载基因的序列,再用DNASTAR进行比对,那是保守区域!
mRNA序列从NCBI上搜如果是常规PCR引物用pp5设计realtime引物搜别人文献里面报道的实在没有再自己设计
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/194473617?report=genbank
我很奇怪,你写的序列怎么没有方向呢?哪端是3’端?哪端是5’端?如果开头那个部分是5’端的话,你的一对引物的序列分别为：5’—gaatgtacgtgccgc—3'5'—actagctacaatcc—3
把这段基因输入设计软件里,调节引物位置,使变性温度在94度,退火温度=Tm-（5到10度）延伸温度72度左右,满足这些条件基本就可以了,当然还要根据实际情况多次实验得到最佳引物.如果你要扩增整个的基因
好像用这个软件设计引物的很少吧,我一般都用PrimerPremier5,或者oligo7.这种专业软件很多专业论坛都有说明书下载,比如生物秀、丁香通、生物谷什么的.
引物设计原则：1、长度：15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性.2、G十c含量
这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段.由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可.
我也做得RT-PCR,是提取某物种中未测序的一段基因.是用近缘物种基因进行比对,得到保守序列设计引物,再提取总RNA,RT-PCR得到目的基因的片段再问：我需要检测的分子，在nucleotide里找不
根据mRNA（真核的）设计的引物,一般如果用DNA做模板的话,那么会出现的情况会是以下几种.一是能扩增出条带,但目标条带比你要的条带要大,因为你会连同内含子一同扩增出来,所以片段会偏大.二是什么都扩增
直接设计只要包含了整个CDS区就可以再问：哦，那CDS和ORF是一样的吗，怎么查找基因的CDS区啊再答：恩差不多回事ORF是DNA上的CDS是mRNA上的看你模板用的是基因组DNA还是cDNA了反正就
根据cDNA序列设计就行了,不用加3‘utr,你做载体构建还是tr-pcr基因检测?再问：做rt-pcr检测。我们老板说要加上3‘utr的序列，不知道为什么？再答：不用加，我做rt-pcr检测那么多了
当然是dna的啦,引物的设计有很多需要注意的地方哦,不然怎么有primer5、oligo7之类设计引物软件呢.
和它的DNA序列比对
那你就去找一段序列,在两边设计引物,在引物的5端挂上酶切位点序列,P完之后就能链接进去
如果设计在内含子序列中,RT-PCR检测到的可能是未被剪切的preRNA或RNA中污染的核DNA,如果设计在外显子序列中,RT-PCR检测到的可能是成熟mRNA,未被剪切的preRNA或RNA中污染的
不用太纠结,有点儿具体也是可以的,一般都能P出来.再问：很多mRNA选择设计不同长度的引物，没有一对是无found显示的，真的很让人纠结；请问文献上的引物有的也是这样吗，不完美，但能扩出来，不会影响q