怎么用NCBI设计跨外显子引物
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/15 18:20:54
这个不同的基因Taqman的探针不一样,它不是通用的,是专一性的,是某个基因的某段序列.然后你选一段小的位置来做为探针,两端分别加上发光基团与淬灭基团,正常情况下他们不发出信号,在PCR扩增的时候他就
合成的单链在实验时又一个和模板结合的退火过程,在这个过程中会自动形成茎环结构,如果你的茎环结构设计合理的话.我也在类似文献上看到过上游引物含有额外的碱基,上面有说明的,是为了调整Tm值.上游引物不能全
你这是mRNA序列还是cDNA序列啊?你目的是什么?引物你设计在什么位置,你还是说清楚点吧!再问:要做的是基因的表达,这个基因是从NCBI上直接查询得到的。http://www.ncbi.nlm.ni
用PP5.0或oligo软件.网上有很多说明书的,操作十分简单再问:等于白说
这是基础知识问题,请抬头,看本页面的导航栏,找到专题,点击进去有个引物设计专题,把上面的资料都研究透彻了,如果还不会再问.同时你也可以去生物秀论坛pcr实验版块看看,相关文章很多.………………
PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列.因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否.要设计引物首先要找到DNA序列的保守区.同时应预测将要扩增的片段
啥都没有的话是无法设计的首先你可以克隆获得内参的序列,再进行下一步实验再问:如果是想用18srRNA这个内参,我该怎么设计引物来得到这段序列呢?再答:这个在各个物种中的同源性很高的,你可以直接用其他物
使用引物设计软件,如果可以最好找公司设计合成,这样有保证.再问:老师要我们自己设计啦···杯具··再答:挺有难度,到网站上找一些设计原则看看。再问:谢谢啦,已经搞定啦··
把你的序列输入框里,然后就点BLAST,就好啦
这问题都上百度知道来问了,你也是生物专业的研究生吧.PrimerPremier5这个软件设计引物用很不错的.
一般要20个碱基的长度,一对,要防止形成发夹.
用primerpremie
反转录的差异显示PCR不同于DNA直接进行PCR.首先,我们需要扩增的是DNA,反转录酶是必须的.楼主应该知道,DNA的PCR不像体内DNA合成那样,体内合成需要RNA引物,而体外是不需要RNA引物,
是编码链.用错链对引物设计有影响,因为核苷酸结构不对称,分三端和五端.所以5'-ATCGXXXXXXXXXXXXXX和3‘-ATCGXXXXXXXXXXXXXX是两个不同的引物分子.引物设计软件都使用
比如说用primer3,你就把找到的包括这个SNP的一段序列copy进去,在你的snp周围用方括号包括一段序列,然后让primer3设计就可以了
普通PCR规则:1、18-25bp;2、Tm值在45-60;3、2个引物之间没有超过5bp的互补序列;4、CG%在40-60%;5、避免连续出现3个以上的CCC或GGG;6、不要迷信百度.
正向:5'GTCACCAGAGCGACAGAT3'18方向:5'CACAGTAGTAGGTGGCTTCA3'20用其他软件设计引物供参考!如有其它要求请具体说明.
看产生二聚体的位置,再修改相应部分碱基..
还是用primerpremier来设计吧然后去ncbi上blast一下看下特异性再问:老师推荐的primer3在线设计,设计出来了以后用blast检测,可惜我看不懂检测结果再答:检测就是看你这对引物所
在NCBI中需要选核算那个选项,然后写出微生物英文缩写名称,另外最好写上该基因片段名称.点击搜索即可.会搜到很多基因,找几个典型的基因,然后复制到txt文档里,用DNAStar的editseq来查询已