rnaseq做snp检测的时候,为什么会检测到基因间区域的

来源：学生作业帮编辑：拍题作业网作业帮分类：生物作业时间：2024/05/16 01:54:15

样品制备过程不纯

用的算法不可靠.目前常用的算法,例如Bowtie,BWA,错误率都比较高,大概3%的错误mapping率.更有甚者Novoalign等算法错误率可高达百分之十几.用超高精度比对算法如FANSe/FANSe2会好得多,但对短reads仍然不可能做到100%正确,错误率可以控制在在1%以下.
测序仪操作不好,测序质量差.注意Illumina的测序仪会谎报Phred quality,故意报高让你以为质量很好.
有基因发生重排的现象.
某些长链非编码RNA(lncRNA)也带有polyA尾巴,在RNA-seq时也会被测序到.

为什么做基因检测? 为什么要做基因检测? PCR为什么能检测基因的多样性为什么检测目的基因是否转录出mRNA用标记的目的基因做探针? 联合基因集团有没有做基因检测的资质? 检测目的基因如果很多材料中可能都含有同一个基因,但是不同材料中此基因的序列有微小差异,即存在SNP位点,现在要检测这些材基因检测的意义是什么? 基因工程目的基因的检测 DNA探针检测法的原理是什么他是怎样检测到目的基因的目的基因的表达为什么不直接检测它的表达,而是要先检测标记基因的表达温湿度计的检测区域范围是多少隔离变压器作用?到现场做试验的时候,我们的检测仪电源不用隔离变压器而直接接220V交流电,检测时干扰很大,用隔离变压器后