应用MEGA构建进化树时是否需要把目的基因序列与同源基因的序列一起转化为FASTA格式,保存一个文件?

来源：学生作业帮编辑：拍题作业网作业帮分类：综合作业时间：2024/04/28 03:26:02

应用MEGA构建进化树时是否需要把目的基因序列与同源基因的序列一起转化为FASTA格式,保存一个文件?
我是MEGA软件初级使用者,现在想建一个目的基因的系统进化树,想请教大家在建树时要将同源基因的核酸或蛋白序列作为比对序列,且转化为FASTA格式,那么在转化后是否需要将目的基因的核酸或蛋白序列也一起转化为FASTA格式,并将其保存一个文件?如果不将目的基因序列一起保存在一个文档的话,建好的进化树会不会只是同源基因间的,而在进化树中找不到目的基因?

不是转化成fas格式,应该是转化成meg格式的,然后在进行发育树的构建.
再问：嗯，请问是否需要也将目的基因的核酸或蛋白序列也一起转化为meg格式，并将其保存一个文件
再答：你先需要将你的目的序列和你需要进行比对的序列一起比对，得到一个比对的结果，将比对的结果保存为fas，在convert称meg格式，我之前做系统发育树的时候是先用bioedit进行比对的，mega没有试过。你可以看看我上传的百度里的关于mega说明书

我最近在构建RNAi载体.在寻找目的基因cDNA与其他基因的非同源序列时,是与DNA比对,还是与cDNA?谢如何把基因序列转化为蛋白序列已知一个小鼠的基因完整序列和CDS序列,请问如何查找这个序列在水稻中的同源基因序列如何把NCBI上搜索到的基因序列以文件的形式保存到本地您好,我想问一下您已知一个基因的序列怎样作它的多序列对比和构建进化树, 怎么把自测序列转换成fasta格式的啊关于基因进化树的构建我已知一个基因ul*的序列,想建立它的进化树!我想问一下,我在Genebank上搜索是用ul*来进行有别人构建好的含有目的基因的表达载体质粒,但是只知道目的基因的mRNA序列,如何做PCR检测目的基因? 人工合成的目的基因DNA序列与人的干素基因外显子DNA序列为什么不一样? 克隆一个未知的基因拿到序列需要多久? 基因序列如何查找一个基因的特异性序列和保守型序列?