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为什么我们进行16S rDNA测序时,要将扩增产物导入的细菌中,而不直接对纯化后的PCR产物直接测序?

来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:生物作业 时间:2024/05/21 18:31:05
为什么我们进行16S rDNA测序时,要将扩增产物导入的细菌中,而不直接对纯化后的PCR产物直接测序?
PCR产物直接测序是用PCR引物进行测序,
而测序两端引物结合位点会有几十个碱基读不出来.
这个是目前技术问题,所有公司的测序仪器都读不出来.
而TA克隆之后就是用载体的通用引物测序,
因为载体的序列是知道的,
所以即使两端有一部分读不清
也没有关系,
这样两个反应就可以测通拼接得到全长序列了.
再问: 谢谢!那么,PCR产物直接测序用时PCR引物进行测序的原理是什么?
再答: 因为TA克隆之后构建的重组质粒量少,不足以进行测序,所以要导入细菌扩增后再进行测序。
再问: 谢谢!想再问一下PCR产物直接测序时,加入引物目的是不是让我们知道读不出来碱基的序列,然后测序技术把引物后的序列读出来,这样我们就知道完整的序列了?
再答: 我不懂你说的什么意思。。。
再问: 我的意思是,PCR产物直接测序时用PCR引物测序,测序两端引物结合位点的几十个碱基读不出来,但是我们知道引物的序列,这样即使引物那一段序列读不出来是不是也不会影响全序列测序?谢谢!
再答: 是的,不影响。头尾几十个碱基出来的测序图谱很难看的,不过你已经知道了序列,也就不要紧了