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求miRNA靶标预测软件PicTar的使用方法,流程,详解,万谢.

来源:学生作业帮 编辑:拍题作业网作业帮 分类:综合作业 时间:2024/05/17 13:11:49
求miRNA靶标预测软件PicTar的使用方法,流程,详解,万谢.
选好种属 输入miRNA名称 点确定. 这还要啥详解 去用targetscan吧 界面更好看懂一些
再问: geneID搞毛用的?targestscan老是出一个界面让我选择一种基因,不懂,太新手,求教
再答: 那是搜一个基因有哪些miRNA可能作用于它的 不用管 你就把上面那个miRNA选了 然后点search for targets of a miRNA就行了 下面出来一个表就是预测的target 最右边的是名字
再问: 最右边不是注释么,还有列出蛋白的名字,refseqID是说啥子的?如果我是一个自己猜的miRNA,没ID,咋整?有相应软件推荐么?
再答: 注释不就是名字么。。。。你是没有生物学基础的 你猜的miRNA? 意思是只有序列么? 隐约记得有个填序列来预测的 但忘了是不是预测miRNA target的 而且这也非常不靠谱
再问: 那对于新发现的未知功能的miRNA有没有一种靶标预测?前人没有做过的如何探测呀,我有一定的基础,不过最新接触生物信息学内容,不太好整,注释里有两项填的都一样啊,那个用名字解释似乎说不过去啊,求教。
再答: 咱俩说的是一个东西么。。。。 注释那栏写的不就是基因的全名和括号里的缩写么 前面NM编号啥的 名字一样的你看清楚后面的数字是一样么 根据miRNA序列来预测target的网站好像有 但我不记得了 你自己去google上找找吧 或者如果你生物信息学够厉害 把Pictar的预测算法文献拿来看看 同样的算法拿去比对一遍mRNA database就行了