NCBI比对ident值为多少时算同源物?

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/25 23:34:05
关于DNA序列在NCBI上比对的问题

正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看

关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种

用contig1软件将上述两段序列拼接后,用拼接结果的反向互补序列进行BLAST.BLAST结果显示,你的菌株与动物乳杆菌,鼠乳杆菌,乳酸乳球菌Maxident均为96%.

NCBI有多少数据库,分别有什么作用

在生物医学信息学领域,数据库和服务的定义与计算机领域有很大的不同,如果要问NCBI过去,现在或将来会有多少数据库,恐怕连NCBI自己都说不清楚.要是一个一个数据库讲下来,9999个字肯定不够用.这里有

甲乙两个正方体放在水平桌面上.它们对桌面的压强相等,压力之比为4:9,则甲乙的密度比为多少

设压强为P则压力F=PS所以二者某一面面积比为4:9所以边长比为2:3所以体积比为8:27易知质量比为压力比4:9,所以甲乙的密度比(4/8):(9:27)=3:2

一块砖平放、侧放、立放在水平面,砖对地面压强比为多少

接地面积的比为4*2:4*1:2*1=4:2:1.而重力不变,因此对地面的压力也不变,所以对地面的压强比为1/4:1/2:1/1=1:2:4

如何在NCBI对刚测出来的基因序列进行同源性分析?

粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做

关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题

ncbi主页进入blast进入nucleotideblast将序列粘入窗口中选择nucleotidecllection(nr/nt)选项进行比对就可以了出来的序列相似性最高的就是你的目的序列再问:这一

怎么在NCBI上比对其他基因?

你在NCBI主页上找一个BLAST.这是一个序列比对在线工具,自己摸索使用啦.基本的序列比对功能一定可以满足的.

NCBI上对序列的描述中olrim是什么意思?

不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个

ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南.

1)输入fasta格式序列2)选择核算比对

NCBI中的BLAST功能可以查多个基因之间的比对吗?

不能,要用多序列比较程序,如clustalw.

NCBI进行BLAST检索时Query coverage的同源百分比和Max ident的百分比分别是什么意思,怎么得到

Querycoverage表示的是所比对序列与目标序列的覆盖度identity表示的是所比对序列与目标序列的相似度.不同的衡量标准,如果是看进化地位,建议建树后比较同源性.

已知三角形三角之比为1:2:3,求所对边的比为多少?

1:根号3:2三个角为306090度直角三角形30度所对应边是斜边一半则求出你都说简单了还问.

我把在NCBI上比对结果为99%的序列,拿来和我的序列再用DNAMAN比对一下,发现相似度只有30%了,为什么呢?

你在用DNAMAN的多序列比对时,在弹出的对话框中可能没有选择“尝试使用双链”吧?包括编码链和非编码连的比对,你测序得到的目的片段可能是非编码链(即你目的基因的编码链的互补序列),而NCBI中提交的序

动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似

动物和植物也有同源性嘛,都是由单细胞生物进化来的,拥有共同的祖先.你这段DNA片段是什么基因的?

如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对

首先找到小鼠和人类p53基因的序列,然后进ncbi首页,里面靠右的位置popularresources下第一个选项“blast”,打开以后,找“nucleotideblast”.进到那个页面有个框就是

有谁知道NCBI blast检测基因序列比对结果怎么看的吗?求懂的大神们指教

直接看不就行了,选了序列,然后点上去,自动跳转……不行就加扣2980364611,这个实验室都该讲的啊……再问:我只是在做我的本科生毕业论文,所以不咋看得懂,我现在主要就是结果那块看不懂,不知道怎么分

NCBI选择数据库我的测序结果在NCBI上比对后,Database选择Nucleotide collection(nr/

原理很简单后者是前者的子集.chromosome只包含所有已经测序的基因组数据.估计你的序列可能只是在高等生物中保守,所以才会出现选择chromosome数据库时相似数量下降非常多.在做BLAST的时

基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗?

可以的,有的基因的同源序列在基因库中很少,一味苛求高的序列相似性是不现实的

NCBI中双序列比对BLAST结果相关问题

你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多