ncbi是哪国的
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/27 10:15:46
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
要确定一个ORF,我个人觉得需要确定上游是否有可能的启动子序列先分析启动子可能位置,再确定ORF.你可以把你克隆的片段上游2k以内的序列,用一些启动子分析软件找下,分析下可能的转录起始位点,再在下游找
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
Amphiprionfrenatus:白条海葵鱼(一种观赏鱼)voucherFMNHBus03-5T-128:编号FMNHBus03-5T-128bonemorphogeneticprotein4ge
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
就查那个基因在下面有详细的描述包括哪哪是外显子再问:有没有什么详细的步骤啊,有点点看不懂那个网站。再答:NCBI首页搜然后点necleotide旁边那个数字然后找到那个基因然后下面各种描述exon后面
好像用proteinworshop可以看
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
先到:选择Nucleotide-nucleotideBLAST(blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个
ncbi中也不是很多吧.那个里面的序列也都是人们提供进去的,有人研究过才有的,不是什么都能查到的百科全书.
我预测蛋白质结构域都是在smart上预测的,是个在线的网站,基本还是蛮准的,另外还有许多网站提供在线预测,不过我只用过smart
查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
提取该物质总RNA做反转录获得cDNA后合成双链根据同源物种的该基因序列设计引物(简并引物)PCR扩增得到目的片段(可能会用到巢式PCR增加特异性)切胶回收纯化质粒载体连接转染筛选获得重组子测序得基因
知道了名字,在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果,然后点击进去,有个“MIM”(在线孟德尔遗传)就可以看到它的功能.ORF是开放阅读框,指的是mRNA上编码氨基酸的那段序列,从AUG开始,直到终止子
序列标签位点sequence-taggedsite,是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间.任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用