NCBI中isolate生物来源的生物个体怎么填
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/29 14:38:36
NCBI没有这样的数据,你可以在CodonUsageDatabase查到相关物种的密码子偏好信息.CodonUsageDatabase数据库用以计算密码子偏好的序列数据都是来自NCBI,也是学术界和工
NCBI要好好学啊先用Google翻译成细胞色素c为CytochromeC在NCBI下列表中选择gene后面填上CytochromeCyeast(酵母的血红蛋白意思,别把中文放上去了哈)有COX9、C
在Genbank中,每条登陆上传的核酸序列都有一个唯一的ID号,可以凭借此ID迅速找到该核酸序列.
粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
就查那个基因在下面有详细的描述包括哪哪是外显子再问:有没有什么详细的步骤啊,有点点看不懂那个网站。再答:NCBI首页搜然后点necleotide旁边那个数字然后找到那个基因然后下面各种描述exon后面
带引号的都是一些数据库中的编号最前面几行是基因的名称染色体位点以及相关的文献的一些信息
Lineage里记录的信息是某个物种的分类地位,即它属于哪个门,哪个纲等等逐级说明.如:人的lineage:cellularorganisms;Eukaryota;Opisthokonta;Metaz
找到一个物种的mRNA序列,用mRNA的序列去进行blast,找同源性高的序列,找不同物种的.就可以了
先到:选择Nucleotide-nucleotideBLAST(blastn)然后在Search旁边那个大方框里填你要寻找的序列,然后点BLAST!然后按Format!这时会弹出一个新的窗口,慢慢等个
找到序列后,ncbi上面靠左一些,屏幕的1/4处,有链接可以直接点.
ncbi中也不是很多吧.那个里面的序列也都是人们提供进去的,有人研究过才有的,不是什么都能查到的百科全书.
PLN是一个缩写词,代表plant,fungal,andalgalsequences,这个词代表GenBank18个子库中的一个.不同的物种序列此处的值会有所不同.18个子库的缩写和全称如下.事实上如
GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性.对于每一条递交给NCBI的序列,都会付给一个编号,而且这个编号对应的序列不可更改.这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与
将你需要比对的蛋白质序列选中,在BLAST界面EnterQuerySequence下面的大框中输入,如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对,再下面的ChooseSearchSet中
打开NCBI网站,在search中选择Nucleotide核酸序列,后面输入你想找序列的拉丁文,搜索,点击序列,选着fasta格式,在上方中间位置send选择file,createfile就下载下来了
知道了名字,在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果,然后点击进去,有个“MIM”(在线孟德尔遗传)就可以看到它的功能.ORF是开放阅读框,指的是mRNA上编码氨基酸的那段序列,从AUG开始,直到终止子
第一个是孤立的意思第二个是隔热的意思不一样吧
你这匹配一致性都算不上高的,当然我也不知道你匹配的是什么了.覆盖率高但一致性低,说明两个序列本身的一致性就很低,进化亲缘性远覆盖率低但一致性高的话,可能在进化上还是有一定亲缘性的,只是某个片段存在较多
你进了NCBI的blast页面之后,粘贴进去序列,下面的programselection选择第三个.结果中有一个“Gallusgallus”,即是家鸡了(应该是从上面数第二个结果).再问:谢谢您的回答