ncbi上如何计算序列同源性的精确值?
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/30 15:55:29
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
粘帖你的序列到www.ncbi.nlm.nih.gov/blast选择你Blast的基因组物种点击即可发给我吧,我给你做
1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
CDS(codingsequence)序列是编码序列,是用来编码蛋白质的那段序列.在NCBINucleotide中输入你要查询的基因,点击查询的序列在出现的结果中,有CDS这一项,底下的核酸序列就是该
进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov,上面搜索条,下拉菜单选gene,后面输入你要找的基因名,加种属名,如人的加homo,点search,选择你要的基因进入,里面有详细介绍,下拉
进行CDS分析,首先要有一段氨基酸序列(基因序列要转换成氨基酸序列),在NCBI首页上第二排链接里点BLAST,进入BLAST页面,在BLAST页面最下方的SpecializedBLAST里的第三个链
看性质可以翻译一下在看嘛
NCBI功能详介和使用方法
找到要的序列,然后最上面有一个“sendto”的下拉菜单,里面有TXT、File、Clipboard三个选项,一般选择以TXT保存或者File保存.
许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号,并且要求你在文章发表时,序列可以被读者索取.NCBI的GenBank提供了两个投递方式:1、在线投递-BankIt,特点是比较方便.2、本地投递文件生
进入NCBI的首页先选择你要的是全序列还是EST然后就输入你要的基因名最好是英文的.进行筛选就行了.不动可以再问很简单.
选核苷酸那个nucleotide在basicblast里面再问:请问是nucleotidecollection,选择这个对吗?还有blast之后,要建树嘛,怎么选择同源性菌株呢?再答:嗯对的建树时同源
可以试试blast程序,在主页的右上方
博凌科为-为你回答之前,提醒你注意一个问题,那就是先要搞清楚gene的大致概念.一般而言,一个完整gene是有起始密码子和终止密码信息的,还有各种已知的其他预示结构,所以1.不管哪个序列,你能找到起始
打开NCBI,数据库选择Nucleotide,用OMPA搜索就行了.再加上目的物种一起搜索就更好了
提取该物质总RNA做反转录获得cDNA后合成双链根据同源物种的该基因序列设计引物(简并引物)PCR扩增得到目的片段(可能会用到巢式PCR增加特异性)切胶回收纯化质粒载体连接转染筛选获得重组子测序得基因
你这个是编号要在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863再问:下面一大块的都是