NCBI 里的 Query ID是什么意思
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/30 14:34:37
正链和反链不就是互补的吗,为什么你还要测两条链?似乎没有必要把,只要测定一条链就OK了.把测出来的序列,粘贴到在NCBI上BLAST序列输入框中blast一下,得到比对的结果里头如果有完全配对的,看看
直接把你的基因blast基因组,基因3’UTR一般有个polyA的标志.另外,推荐使用UCSC(google之),和基因组相关的这个网站做的不错
NCBI要好好学啊先用Google翻译成细胞色素c为CytochromeC在NCBI下列表中选择gene后面填上CytochromeCyeast(酵母的血红蛋白意思,别把中文放上去了哈)有COX9、C
要确定一个ORF,我个人觉得需要确定上游是否有可能的启动子序列先分析启动子可能位置,再确定ORF.你可以把你克隆的片段上游2k以内的序列,用一些启动子分析软件找下,分析下可能的转录起始位点,再在下游找
搜到的序列有些是包含基因所在的染色体片段的,所以很长;有些是该基因的全长序列,包括基因的编码区和非编码区;cds的就是基因的编码区序列.主要看你的目的来选择的.
打开后在Search中选择Nucleotide再在下面输入FRAT1点击Search即可也可输入具体的物种名以缩小范围.
Amphiprionfrenatus:白条海葵鱼(一种观赏鱼)voucherFMNHBus03-5T-128:编号FMNHBus03-5T-128bonemorphogeneticprotein4ge
NCBI(美国国家生物技术信息中心)NCBI的主要任务是发展新的信息学技术,来帮助对那些控制健康和疾病的基本分子和遗传过程的理解.
不是的.isolate后面指的是该序列来源的生物个体,说白了就是一个名字或者代号.比如从张三身上获得了一个基因,然后isolate后面就可以写zhangsan至于olrim175,完全是提交者自己凭个
访问号:NM_001127660.1——变体1TranscriptVariant1:Thisvariant(1)representsthelongertranscript.NM_014874.3——变
mRNA,completecds意即根据rna翻译的cDNA序列.没有内含子的
这是有可能的,因为NCBI数据库中没有该物种的序列信息,在综合楼上的,就可以了.
因为NCBI是按模板链给的,毕竟基因间的比对用得较多,改成U太麻烦,你自己知道mRNA中T应该是U就好了
查mRNA的话,在NCBI主页上AllDatabases下拉框处选择Neucleotide,在右侧搜索框里填上你想搜的基因的名字就OK了,得到的就是你这个基因在不同物种里面的序列,在新页面右侧TopO
参考序列下面是两的对照网站英文http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/中文http://translate.google.com/translate?hl=zh-CN&s
登陆ncbi主页,选择Gene数据库(不建议选All database),在搜索栏中输入“Sus scrofa domesticus mitochondrion
ncbi序列既有cDNA序列也有mRNA序列,一般会有注释的.如果已经说明是mRNA就不可能是cDNA.mRNA是以正义链的形式给出的,所以是T而不是U.这可能是因为序列提交者一般只对DNA测序,而很
序列标签位点sequence-taggedsite,是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间.任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用
你这个是编号要在Nucleotide里找,你是选的在gene里找的吧.直接把序列连接给你:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AK065863再问:下面一大块的都是
编码链.因为你从NCBI上可以用它的ORF搜索工具搜索DNA上的ORF的.软件识别的是DNA序列上的ATG和TAA\TAG\TGA的.因此它的DNA序列肯定是编码链的.