对细菌16s rDNA进行BLAST比对的步骤
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/28 10:18:16
属于受环境影响而产生的基因突变,是可遗传变异!目前认为产生耐药菌的主要原因是:长期应用抗生素时,占多数的敏感菌株不断被杀灭,耐药菌株就大量繁殖,代替敏感菌株,而使细菌对该种药物的耐药率不断提高!抗生素
还需要和菌种的形态学观察、生理生化结果(参照《伯杰氏细菌手册》第8版相关内容进行)综合参考才能得出结论.再问:好比说我现在16srDNA鉴定到了属,接着就从这个属开始做一些生理生化实验,最后得出结果吗
细菌生长繁殖需要氮源,如果没有氮源,细菌就不能完成生命活动.而尿素中的氮,一般的细菌是无法利用的,只有尿素分解菌可以利用尿素中的氮作为氮源.因此只需要设计一个培养基,使其中只有尿素为唯一氮的来源,这时
【实验内容及步骤】一、分离1.\x05制备土壤悬液及系列稀释液称取土壤1g,放入99mL无菌水的三角瓶中,振荡10min,即为稀释10-2的土壤悬液.另取装有无菌试管5支,用记号笔编上10-3、10-
细菌内毒素为外源性致热原,它可激活中性粒细胞等,使之释放出一种内源性热原质,作用于体温调节中枢引起发热.主要具有以下生物活性:1、致热性.2、致死性毒性.3、白细胞减少.4、Shwartzman反应.
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北京三博远志16srdna测序/鉴定说明:1、样品形式可以是新鲜菌液、斜面培养基、平面培养基或者提取好的DNA.2、如果样品为基因组DNA,DNA浓度>20ng/ul,体积大于20ul.3、鉴定结果一
都可以的,你给测序公司的测序订单上可以填清楚样品类型,可以是菌液,质粒,DNA片段等等.
实验室所观察的玻片标本可分三种:切片——生物体上切取的薄片制成;装片——从生物体上撕取或挑取的材料制成;涂片——液体的生物材料涂抹而成.这三种都可以制成永久的和临时的.永久装片和临时装片制作过程基本一
革兰氏染色法是细菌学中广泛使用的一种鉴别染色法,1884年由丹麦医师Gram创立.未经染色之细菌,由于其与周围环境折光率差别甚小,故在显微镜下极难观察.染色后细菌与环境形成鲜明对比,可以清楚地观察到细
首先从形态学入手,观察菌落形态,颜色,油镜和电镜下观察菌体形态.生理生化测定,指标很多,参见《伯杰氏细菌鉴定手册》,如产酸,硝化,等等.分子鉴定,扩增16SrDNA片段,测序,NCBI比对序列,做树状
--16srDNA不是提取出来的~菌液提取基因组DNA,然后PCR扩增,引物用通用引物27F和1492R,扩增得到的1.5KB大小的产物就是16srDNA.然后你把PCR产物纯化一下送交测序公司测序,
你好,我的回答.1、肯定能剪切,不能的话它DNA就不能复制,也就不能分裂了2、人类基因组计划是测试人类所有染色体的序列,而生物工程的定义你可以看高中生物书相关章节,意义根本没有联系!谢谢提问!
这有啥好系统讲的,单端测序的数据比对一下就完了,还能咋样?
V3区是在通用引物所扩增的序列的一部分.V3区引物的变异性相对于通用引物27F/1492R而言更高.
生物一般的生存温度在0摄氏度到60摄氏度之间,但也有一些极端类型,比如某些细菌可是在七八十度甚至一百度的温泉中生活.压力也是如此.所以灭菌操作实际上是一种针对绝大多数生物的杀灭,而不是绝对的百分之百.
最好还是先根据细菌形态进行初步的鉴定,然后按照革兰氏染色步骤操作.革兰氏染色法一般包括初染、媒染、脱色、复染等四个步骤,具体操作方法是:1)涂片固定.2)草酸铵结晶紫染1分钟.3)自来水冲洗.4)加碘
这么说吧,NCBI是个乱七八糟的地方,很多序列是不可信的.你只看匹配率就行了,其他不用管.比如我分离得到的一个新的细菌,比对之后发现最相近的是是E.coli,但是其实相似度最高也不过92%,换句话说,
双向测序得到的两个序列如果有重叠区的话,那么可以做拼接.另外NCBI的blastn可以做两个序列的比较,通过blastn比较可以看两个序列有没有重叠序列.做拼接有专门的软件,如DNAstar里面的Se
观察单个细菌的话,要看形态、大小,有无荚膜、鞭毛等等,其他结构的话那就要具体看细菌种类确定.观察菌落的话,那还要观察菌落的大小、颜色、边缘形状等.